Ağaç adam sendromlu kişilerin bağışıklık sistemi genelde tüm enfeksiyonlarla mücadele etme yeteneğine sahipken insan papilloma virüsü (HPV) ile savaşamamaktadır.
İnsan papilloma virüsü (HPV) dışında, insan bağışıklık yetmezliği virüsü (HIV) gibi farklı virüslerin de hastalığın gelişiminde rol oynadığı kanıtlanmıştır. Yani, bu virüslerle enfekte olan bazı kişiler zamanla bu hastalığa yakalanabilirler. Söz konusu virüslerden salgılanan ve siğil benzeri lezyonlara neden olan kimyasal maddeler, uygun koşullarda ağaç adamı sendromunda görülen ileri düzey cilt rahatsızlığına yol açmaktadır.
Lezyonların vücudun her yerinde ortaya çıkma olasılığı eşit değildir. Güneşin zararlı ışınlarına maruz kalan cilt bölgelerinde daha da yoğunlaştığı saptanmıştır.
Bu sendroma sahip hastalarda özellikle yirmili-otuzlu yaşlarda cilt kanseri gelişme riski de oldukça yüksektir.